甘肃医学院马克思主义学院成立于2018年11月，是学校党委直接领导的二级教学科研机构，主要承担全校本、专科学生的思想政治理论课教学、马克思主义理论研究，以及党和国家最新理论、政策的宣讲工作。

学院目前设有马克思主义学院党支部、办公室、教务科3个党政管理机构，以及“习近平新时代中国特色社会主义思想概论”“马克思主义中国化”“思想政治教育”“马克思主义基本原理”“形势与政策”5个教研室，面向全校学生开设思想道德与法治、中国近现代史纲要、马克思主义基本原理、毛泽东思想和中国特色社会主义理论体系概论、习近平新时代中国特色社会主义思想概论、形势与政策共6门思想政治理论必修课，另开设中共党史、新中国史、改革开放史、社会主义发展史共4门选择性必修课程及军事理论课。

学院现有思想政治理论课专职教师31人，其中副高及以上职称11人，中级职称12人，中级以下职称8人；博士4人，硕士14人，学士13人。

近年来，学院先后荣获“2020年先进基层党组织”“平凉市理论宣讲先进集体”等荣誉称号，2023年获批第四批甘肃省思想政治理论课名师工作室。教师队伍中，1人被评为“甘肃省优秀青年人才”，1人获“甘肃省技术标兵”称号，1人获“平凉市理论宣讲先进个人”称号，1人获评平凉市“最美退役军人”，另有多名教师获校级“优秀党员”“优秀教师”“先进工作者”等荣誉。科研与教学成果方面，近年来学院获批各级各类科研项目22项；发表论文40余篇，其中高水平论文5篇；主编、参编教材5部，出版专著4部；荣获“大学生领航计划”优秀奖3项，甘肃省教育厅优秀教学案例二等奖1项，甘肃省大学生讲思政课公开课教学比赛二等奖1项、三等奖2项。

学院始终坚持“马院姓马、在马言马”的鲜明导向，围绕学校医学人才培养目标，坚持不懈用习近平新时代中国特色社会主义思想铸魂育人，努力发挥好马克思主义学院作为意识形态“主阵地”、思想政治理论课作为意识形态“主渠道”、思想政治理论课教师队伍作为“主力军”的重要作用。